Самая загадочная база из всех...так как сюда не легко попасть даже опытным АНБУ, ибо эта организация защищасет совсем другие интересы. Она работает на своего загадочного лидера Данзо, который ведёт Коноху к разрушению, ведь когда-то именно Данзо проиграл Третьему и не получил звания Хокаге, теперь он, с помощью своих подчинённых, осуществляет план мести. Единственным исключением из всех правил Корня, является Сай, который теперь входит в состав команды Какаши.